Ilustrator je knjiga Il manuale di autodifesa televisiva Patrizija Roversija (izdavač Sperling & Kupfer) te Il manuale della tap-model Syusy Blady (izdavač Longanesi).
Na poziv Sergija Bonellija 1992. pridružuje se radu na serijalu Martina Mysterea, gdje prvo crta kratke priče (prva objavljena je Miniere e lattine). Dvije godine nakon toga izlazi i prvi njegov regularni Martin (epizoda Dekameron), a 1998. njegov vjerojatno i najbolji rad, Gigant Il segreto delle ombre diafane.
Iste godine, s Alfredom Castellijem započinje rad na novom spin off serijalu Martina Mysterea - Docteuru Mystereu - prvo objavljenom u Almanahu misterija, a koji je nakon pet realiziranih epizoda zaključen. Danas, u obliku albuma izlazi na više europskih jezika, a do sada su objavljena dva albuma, dok je treći u pripremi. Za serijal Martina Mysterea Filippucci je nacrtao i jedan specijalni broj - L'ultimo concerto (1996.).